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Profilazione a livello di genoma delle interazioni di legame tra fattore di trascrizione e DNA in Candida albicans: un metodo CUT&RUN completo e un flusso di lavoro di analisi dei dati
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Biology
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JoVE Journal Biology
Genome-wide Profiling of Transcription Factor-DNA Binding Interactions in Candida albicans: A Comprehensive CUT&RUN Method and Data Analysis Workflow
DOI:

07:48 min

April 01, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:49Isolation of Nuclei and Primary Antibody Binding
  • 02:40Binding of pAG-MNase to Antibody
  • 03:36Library Preparation for Sequencing
  • 05:22CUT&RUN Sequence Analysis
  • 05:54Results: Quality Control Steps and Evaluation of Ndt80 and Efg1 Enriched Peaks Using CUT&RUN Protocol
  • 07:22Conclusion

Summary

Automatic Translation

Questo protocollo descrive un metodo sperimentale e un flusso di lavoro di analisi dei dati per la scissione sotto bersagli e il rilascio utilizzando la nucleasi (CUT & RUN) nel patogeno fungino umano Candida albicans.

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