MALDI-TOF का उपयोग ऑक्सीकृत आरएनए और एक्सोरिबोन्यूक्लिएज Xrn-1 के बीच प्रतिक्रियाशीलता से प्राप्त टुकड़ों को चिह्नित करने के लिए किया गया था। वर्तमान प्रोटोकॉल एक ऐसी पद्धति का वर्णन करता है जिसे आरएनए और / या डीएनए से जुड़ी अन्य प्रक्रियाओं पर लागू किया जा सकता है।