Summary

ゲートウェイ互換二分子蛍光相補(BiFC)システムを使用してプラントにおけるタンパク質相互作用の検出

Published: September 16, 2011
doi:

Summary

我々は、植物におけるタンパク質間相互作用をテストする手法を開発した。黄色蛍光タンパク質(YFP)がつの非オーバーラップフラグメントに分割されます。各断片は融合タンパク質の発現を可能にする、ゲートウェイのシステムを経由して目的の遺伝子にインフレームでクローニングされる。検死のタンパク質が相互作用するときにYFPシグナルの再構成にのみ発生します。

Abstract

我々は、 生体内の 2つのタンパク質間相互作用をテストするBiFC技術を開発しました。これは二つの非重複フラグメントに分割することにより、黄色蛍光タンパク質(YFPを)実現されます。各断片は、目的の遺伝子にインフレームでクローニングされる。これらのコンストラクトは、融合タンパク質の輸送の発現を可能にする、 アグロバクテリウム媒介形質転換によりタバコbenthamianaに同時形質転換することができる。検死のタンパク質が1-7をやり取りするときにYFPシグナルの再構成にのみ発生します。タンパク質 – タンパク質相互作用をテストおよび検証するために、BiFCは酵母ツーハイブリッド(Y2H)アッセイと一緒に使用することができます。これは、Y2Hで見落とされることができる間接的な相互作用を検出する場合があります。 Gatewayテクノロジは、できるだけ8,9限り多くの発現および機能解析システムにシャトルに興味のある遺伝子(GOI)の研究者を可能にする普遍的なプラットフォームです。方向とリーディングフレームの両方が表現対応のクローンを作るために制限酵素やライゲーションを使用せずに維持することができます。結果として、一つは実験全体で一貫した結果を確保するために、すべての再シーケンシングのステップをなくすことができます。我々はBiFCとY2H両方アッセイ10を実行するために使いやすいツールを研究者に提供するゲートウェイ互換BiFCとY2H一連のベクトルを作成している。ここで、我々は、Nのタンパク質-タンパク質相互作用をテストするために私達のBiFCシステムを使用してのしやすさを示すbenthamiana植物

Protocol

1。 アグロバクテリウム培養液の調製 アグロバクテリウム菌株GV3101は、以前にゲートウェイの互換性のあるBiFCベクトルpEarleyGate201 – YCとpEarleyGate202 – YN、融合GOI構築物を含む各で形質転換。 BiFC融合タンパク質の5 mlのYEB(5G L -1の牛肉エキス、1G L -1の酵母エキス、5G L -1ペプトン、5G L -1スクロース、2mMのMgSO 4を用い 、pH7.2)?…

Discussion

BiFCアッセイはタンパク質相互作用を研究するための強力なツールです。従来のY2Hアッセイとは異なり、BiFCだけでなく、タンパク質 – タンパク質相互作用を可視化できるだけでなく、サブ細胞内局在などのタンパク質複合体の詳細な情報を提供します。また、2つの候補タンパク質が第三のパートナーが十分に近づけることができる限り、間接的な相互作用を検出することが可能です。あらゆ…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

私たちは、原稿と一般的なラボの援助を読み取るためのVi Nguyenさんに感謝。

Materials

Name of the reagent Company Catalogue number
Acetosyringone Sigma D134406
MES hydrate Sigma M2933
1 mL slip-tip tuberculin syringe BD 309602

References

  1. Ohad, N., Yalovsky, S. Utilizing bimolecular fluorescence complementation (BiFC) to assay protein-protein interaction in plants. Methods in molecular biology. 655, 347-358 (2010).
  2. Fang, Y., Spector, D. L. BiFC imaging assay for plant protein-protein interactions. Cold Spring Harbor protocols. 2, (2010).
  3. Schutze, K., Harter, K., Chaban, C. Bimolecular fluorescence complementation (BiFC) to study protein-protein interactions in living plant cells. Methods in molecular biology. 479, 189-202 (2009).
  4. Hiatt, S. M. Bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analysis of protein interactions in Caenorhabditis elegans. Methods. 45, 185-191 (2008).
  5. Barnard, E. Development and implementation of split-GFP-based bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assays in yeast. Biochemical Society Transactions. 36, 479-482 (2008).
  6. Kerppola, T. K. Design and implementation of bimolecular fluorescence complementation (BiFC) assays for the visualization of protein interactions in living cells. Nature. 1, 1278-1286 (2006).
  7. Hu, C. D., Grinberg, A. V., Kerppola, T. K. Visualization of protein interactions in living cells using bimolecular fluorescence complementation (BiFC) analysis. Current protocols in cell biology. 21, 3-3 (2006).
  8. Earley, K. W. Gateway-compatible vectors for plant functional genomics and proteomics. The Plant journal : for cell and molecular biology. 45, 616-629 (2006).
  9. Karimi, M., Inze, D., Depicker, A. GATEWAY vectors for Agrobacterium-mediated plant transformation. Trends in Plant Science. 7, 193-195 (2002).
  10. Lu, Q. Arabidopsis homolog of the yeast TREX-2 mRNA export complex: components and anchoring nucleoporin. The Plant journal : for cell and molecular biology. 61, 259-270 (2010).
  11. Sparkes, I. A. transient expression of fluorescent fusion proteins in tobacco plants and generation of stably transformed plants. Nature protocols. 1, 2019-2025 (2006).
  12. Rackham, O., Brown, C. M. Visualization of RNA-protein interactions in living cells: FMRP and IMP1 interact on mRNAs. The EMBO journal. 23, 3346-3355 (2004).
  13. Demidov, V. V. Fast complementation of split fluorescent protein triggered by DNA hybridization. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 2052-2056 (2006).
  14. Shyu, Y. J., Suarez, C. D., Hu, C. D. Visualization of ternary complexes in living cells by using a BiFC-based FRET assay. Nature. 3, 1693-1702 (2008).
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Cite This Article
Tian, G., Lu, Q., Zhang, L., Kohalmi, S. E., Cui, Y. Detection of Protein Interactions in Plant using a Gateway Compatible Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) System. J. Vis. Exp. (55), e3473, doi:10.3791/3473 (2011).

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