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Analysant l'expression de gènes à partir communautés microbiennes marines utilisant Transcriptomique environnement
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
DOI:

13:51 min

February 18, 2009

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Chapters

  • 00:00Title
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

Automatic Translation

Nous présentons une méthode pour générer des ADNc de l'ARNm de l'environnement. En général, l'ARN total est d'abord recueilli de l'environnement, l'ARNr est enlevé sélectivement, l'ARNm est sélectivement amplifié, et l'ADNc synthétisé à partir de la piscine ARNm enrichi est séquencé. Séquences récupérés peuvent être annotés en utilisant des techniques standard de la bioinformatique pour identifier les gènes exprimés.

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