Journal
/
Biology
/
ניתוח ביטוי גנים מקהילות מיקרוביאלית ימית באמצעות Transcriptomics הסביבה
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ניתוח ביטוי גנים מקהילות מיקרוביאלית ימית באמצעות Transcriptomics הסביבה

DOI:
10.3791/1086-v

•

13:51 min

•

February 18, 2009

•

, , , ,
1Department of Marine Sciences,University of Georgia (UGA)

Chapters

  • 00:00Title
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

אנו מציגים שיטה להפקת cDNA מ-mRNA הסביבה. באופן כללי, הכולל RNA נאסף הראשון הסביבה, rRNA מוסר סלקטיבי, mRNA מוגבר באופן סלקטיבי, ועל cDNA מסונתז ממאגר mRNA מועשר הוא רצף. רצפים ששוחזרו ניתן להוסיף הערות באמצעות תקן טכניקות ביואינפורמטיקה כדי לזהות את הגנים לידי ביטוי.

Tags

Gene ExpressionMarine Microbial CommunitiesEnvironmental TranscriptomicsMetatranscriptomicsMRNA SequencingProkaryotic MRNAPoly(A) TailsEukaryotic MessagesClone LibrariesRandom PrimersCDNA SynthesisLinear AmplificationIn Vitro Transcription

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

הקהילות מיקרוביאלית בטבע מעבדה - ראיון

ביולוגיה של הקהילות מיקרוביאלית - ראיון

Gene Expression חיידקית ניתוח שימוש microarrays

הכנת ראשי בתרביות תאים hematopoietic ממח העצם Murine עבור electroporation

שימוש ג'ין Pulser מערכת MXcell electroporation כדי Transfect תאים ראשוניים עם יעילות גבוהה

שימוש מונה תא אוטומטי כדי לפשט את הביטוי מחקרים ג'ין: siRNA מציאה הביטוי IL 4-Gene תלויים תאים Namalwa

ב הכינון במבחנה של ט פעילים castaneum שהטלומרז

הפקת DNA גבוהה מולקולרית משקל של מאטס מיקרוביאלית

ריכוז מטבוליטים של צפיפות נמוכה עבור קהילות Planktonic metabolomics הסביבה באמצעות תהודה מגנטית גרעינית ספקטרוסקופיה

באמצעות רצף מעצר SecM ככלי לבודד פוליפפטידים כרוכים הריבוזום

Read Article