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Analisando Expressão Gênica de comunidades microbianas Marinha usando transcriptômica Ambiental
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Biology
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JoVE Journal Biology
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
DOI:

13:51 min

February 18, 2009

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Chapters

  • 00:00Title
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

Automatic Translation

Nós apresentamos um método para gerar cDNA de mRNA ambiental. Em geral, o total de RNA é a primeira coletados do ambiente, rRNA é seletivamente removido, mRNA é seletivamente amplificado, e cDNA sintetizado a partir do pool de mRNA enriquecido é seqüenciado. Seqüências recuperadas podem ser anotados usando técnicas padrão de bioinformática para identificar os genes expressos.

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