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Valutazione della immunologicamente rilevanti dinamiche Caratteristiche strutturali del terziario di HIV-1 sequenza R2 Loop Corona V3 da Ab initio Pieghevole
JoVE Journal
Immunology and Infection
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JoVE Journal Immunology and Infection
Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding
DOI:

10:50 min

September 15, 2010

,

Chapters

  • 00:00Title
  • 01:07Introduction
  • 01:57R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding via the ICM-Pro GUI
  • 04:19R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding via the ICM-Pro Command Line
  • 06:35 ab initio Folding Data Analysis
  • 08:41Representative Results for R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding
  • 09:59Conclusion

Summary

Automatic Translation

La regione corona di diverse sequenze ciclo V3 della glicoproteina busta superficie (gp120) del virus HIV-1 può essere strutturalmente caratterizzata in molti casi in ripiegamento silico di posizioni 10 a 22 del circuito con un state-of-the-art<em> Ab initio</em> Algoritmo pieghevole. Qui mostriamo la piegatura e la valutazione di questa regione del ciclo V3 R2 dal ceppo di HIV-1, un unico ceppo neutralizzazione sensibili con sconcertante proprietà funzionali.

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