En fremgangsmåte er beskrevet for merking nevroner med fluorescerende fargestoffer i forutbestemte funksjonelle mikro-domener av neocortex. Først, egenverdi signal optisk imaging brukes for å oppnå en funksjonell kart. Deretter to-foton mikroskopi brukes for å merke og image nevroner innenfor mikro-domene på kartet.