Vi beskriver en metode for å spore endomembransystemet brudd oppstår ved de intracellulære bakterier<em> Shigella flexneri<em></em</em> Og<em<em><em> Mycobacterium tuberculosis</em></em</em> På vertscellen invasjon. Vår analyse gjør bruk av CCF4, en rekke cytoplasma FRET sonde i levende eller faste celler. Dette reporter er degradert av en enzymaktivitet til stede på den bakterielle overflate.