Kombinationen av kromatin immunoprecipitation och ultra-high-throughput sekvensering (chip-punkter) kan identifiera och kartlägga protein-DNA interaktioner i en viss vävnad eller cellinje. Beskrivs är hur man skapar en hög mall kvalitet chip för efterföljande sekvensering, med erfarenhet av transkriptionsfaktor TCF7L2 som ett exempel.