Journal
/
Biology
/
Upptäcka Somatiska genetiska förändringar i tumörprover från Exon Capture och Massively Parallel sekvense
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Upptäcka Somatiska genetiska förändringar i tumörprover från Exon Capture och Massively Parallel sekvense

DOI:
10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

, , , ,
1Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 2Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver framställningen av streckkodade DNA-bibliotek och efterföljande hybridisering-baserade exon fånga för detektion av viktiga cancerassocierade mutationer i kliniska tumörprover av massivt parallella "nästa generations" sekvensering. Riktad exon sekvense erbjuder fördelarna med hög genomströmning, låg kostnad, och djup sekvenstäckning, vilket således ger hög känslighet för att detektera lågfrekventa mutationer.

Tags

Somatic Genetic AlterationsTumor SpecimensExon CaptureMassively Parallel SequencingNext-generation SequencingCancer-associated MutationsSequence MutationsCopy Number AlterationsStructural RearrangementsTargeted Exon SequencingHigh ThroughputLow CostDeep Sequence CoverageHigh Sensitivity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

CD4 + T-lymfocyter ta med en engångs Mikroflödessystem Chip för HIV

Dubbel Hela Montera in situ hybridisering för tidig kycklingembryon

In vivo Reprogramming of Adult Somatic Cells to Pluripotency by Overexpression of Yamanaka Factors

Effektiv Generation Human inducerade pluripotenta stamceller från mänskliga somatiska celler med Sendai-virus

Linjär Förstärkning medierad PCR - Lokalisering av genetiska element och karakterisering av Okänd Flanking DNA

Massively Parallel Reporter Analyser hos odlade däggdjursceller

Fekal Glukokortikoid Analys: Icke-invasiv Adrenal Övervakning av equids

Riktade RNA Sequencing analys för att karaktärisera Gene Expression och Genomic Ändringar

Samtidig mätning av mitokondrie kalcium och mitokondriell membranpotential i levande celler genom fluorescensmikroskopi

Interactome-Seq: Ett protokoll för Domainome bibliotek konstruktion, validering och urval av Phage Display och nästa generations sekvensering

Read Article