Journal
/
/
Upptäcka Somatiska genetiska förändringar i tumörprover från Exon Capture och Massively Parallel sekvense
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing
DOI:

11:02 min

October 18, 2013

, , , ,

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Automatic Translation

Vi beskriver framställningen av streckkodade DNA-bibliotek och efterföljande hybridisering-baserade exon fånga för detektion av viktiga cancerassocierade mutationer i kliniska tumörprover av massivt parallella "nästa generations" sekvensering. Riktad exon sekvense erbjuder fördelarna med hög genomströmning, låg kostnad, och djup sekvenstäckning, vilket således ger hög känslighet för att detektera lågfrekventa mutationer.

Related Videos

Read Article