Journal
/
Biology
/
Oppdager Somatiske genetiske forandringer i vevsprøver av Exon Capture og massivt parallelle Sekvense
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Detecting Somatic Genetic Alterations in Tumor Specimens by Exon Capture and Massively Parallel Sequencing

Oppdager Somatiske genetiske forandringer i vevsprøver av Exon Capture og massivt parallelle Sekvense

DOI:
10.3791/50710-v

•

11:02 min

•

October 18, 2013

•

, , , ,
1Department of Pathology,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 2Human Oncology and Pathogenesis Program,Memorial Sloan-Kettering Cancer Center

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:08Library Preparation: End Repair
  • 04:12Library Preparation: dA-Tailing and Adapter Ligation
  • 05:55Roche Nimblegen SeqCAP EZ Library Hybridization, Wash, and Amplification
  • 08:31Tumor-normal Pair Analysis
  • 10:08Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Vi beskriver utarbeidelse av strekkode DNA biblioteker og påfølgende hybridisering basert ekson fangst for påvisning av viktige kreftassosierte mutasjoner i kliniske vevsprøver av massivt parallelle "neste generasjon" sekvensering. Målrettet exon sekvense tilbyr fordelene med høy gjennomstrømning, lav kostnad, og dyp-sekvens dekning, noe som gir høy følsomhet for påvisning av lavfrekvente mutasjoner.

Tags

Somatic Genetic AlterationsTumor SpecimensExon CaptureMassively Parallel SequencingNext-generation SequencingCancer-associated MutationsSequence MutationsCopy Number AlterationsStructural RearrangementsTargeted Exon SequencingHigh ThroughputLow CostDeep Sequence CoverageHigh Sensitivity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

CD4+ T-Lymphocyte Capture Using a Disposable Microfluidic Chip for HIV

Double Whole Mount in situ Hybridization of Early Chick Embryos

In vivo Omprogrammering av Adult somatiske celler til pluripotency ved Overuttrykte av Yamanaka Faktorer

Effektiv Generation Menneskelig indusert pluripotent stamceller fra menneskelige somatiske celler med Sendai-virus

Linear Amplification Mediated PCR - Lokalisering av genetiske elementer og karakterisering av Unknown flankerer DNA

Massivt Parallelle Reporter Analyser i dyrkede pattedyrceller

Fecal Glukokortikoid analyse: Ikke-invasiv Adrenal Monitoring i Equids

Målrettet RNA sekvense analysen å karakter Gene Expression og Genomisk Endringer

Samtidig Måling av mitokondrie Kalsium og Mitokondriell membranpotensialet i levende celler med fluorescerende mikros

Interactome-Seq: En protokoll for Domainome biblioteket konstruksjon, validering og utvalg av Phage Display og neste generasjons sekvensering

Read Article