Journal
/
Biology
/
Compleet Workflow voor Analyse van histon post-translationele modificaties Met behulp van Bottom-up Massaspectrometrie: Van Histon Extraction om Data Analysis
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Compleet Workflow voor Analyse van histon post-translationele modificaties Met behulp van Bottom-up Massaspectrometrie: Van Histon Extraction om Data Analysis

DOI:
10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

, , , ,
1Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
  • 03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
  • 05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
  • 07:43Sample Desalting with Stage-tips
  • 08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
  • 10:10Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dit protocol beschrijft een volledig geïntegreerde workflow voor het karakteriseren histon post-translationele modificaties met massaspectrometrie (MS). De workflow bevat histon zuivering uit celkweken of weefsels, histon derivatisering en de spijsvertering, MS analyse met behulp van nano-flow vloeistofchromatografie en instructies voor gegevensanalyse. Het protocol is ontworpen voor de voltooiing binnen 2-3 dagen.

Tags

HistonePost-translational ModificationsMass SpectrometryBottom-up ProteomicsHistone ExtractionChromatin BiologyGene Expression RegulationChromosome CondensationEpigenetic ChangesChromatin OperationCell CultureHistone DerivatizationHistone DigestionNanoflow Liquid Chromatography

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Detectie van post-translationele modificaties op native Intact Nucleosomen door middel van ELISA

Detectie van histon Wijzigingen in bladeren

Expressie analyse van zoogdieren Linker-histon Subtypes

Een kwantitatieve analyse Fitness Workflow

Ontluikende Gist Protein extractie en zuivering voor de Studie van de functie, interacties, en post-translationele modificaties

Identificatie van post-translationele modificaties van Plant eiwitcomplexen

Bottom-up en Shotgun Proteomics een uitgebreide Cochlear Proteome Identificeer

Verrijking van extracellulaire matrix eiwitten uit weefsels en de spijsvertering in peptiden voor massaspectrometrie Analyse

Bereiding van de monsters voor Proteomics-analyse op basis van massa-spectrometrie van oogbeschadigingen en/of Microvessels

Gelijktijdige affiniteitsverrijking van twee posttranslationele wijzigingen voor kwantificering en sitelokalisatie

Read Article