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Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq
DOI:

09:08 min

November 13, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:54Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction
  • 03:18Transposition Reaction and Library Amplification
  • 04:33Size Selection of ATAC-seq Libraries
  • 06:48Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads
  • 08:07Conclusion

Summary

Automatic Translation

Dosage pour la Transposase Accessible chromatine couplé avec le séquençage haut-débit (ATAC-seq) est une méthode de Génome-large pour découvrir la chromatine accessible. Il s’agit d’un protocole étape par étape de ATAC-seq, du moléculaire à la dernière analyse computationnelle, optimisé pour les lymphocytes humains (Th1/Th2). Ce protocole peut être adopté par les chercheurs sans expérience préalable dans les méthodes de séquençage de prochaine génération.

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