A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 00:54Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction
- 03:18Transposition Reaction and Library Amplification
- 04:33Size Selection of ATAC-seq Libraries
- 06:48Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads
- 08:07Conclusion
Test för Transposase-tillgänglig kromatin i kombination med hög genomströmning sekvensering (ATAC-seq) är en genome-wide metod att avslöja tillgänglig kromatin. Detta är en steg för steg ATAC-seq protokoll, från molekylär till den slutliga computational analysen, optimerad för humana lymfocyter (Th1/Th2). Detta protokoll kan antas av forskare utan tidigare erfarenhet av nästa generations sekvenseringsmetoder.
