Journal
/
Genetics
/
Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Rare Event Detection Using Error-corrected DNA and RNA Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing

DOI:
10.3791/57509-v

•

10:36 min

•

August 03, 2018

•

, , ,
1Department of Pediatrics, Division of Hematology and Oncology,Washington University School of Medicine, 2Center for Genome Sciences and Systems Biology,Washington University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:33Incorporating i5 and i7 Adapters onto Error-corrected Sequencing Libraries
  • 03:36Quantifying the Libraries with QX200 Digital Droplet PCR (ddPCR)
  • 06:14Amplifying and Normalizing the Libraries for Sequencing
  • 07:37Results: Mutation-calling with Error-corrected Sequencing (ECS)
  • 09:14Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Volgende-generatie rangschikken (NGS) is een krachtig hulpmiddel voor genomische karakterisering die wordt beperkt door het hoge foutenpercentage van het platform (~0.5–2.0%). Wij beschrijven onze methoden van fout-gecorrigeerde sequentie die ons toelaten te ondervangen van het NGS foutenpercentage en mutaties op variant allel breuken zo zeldzaam als 0,0001 detecteren.

Tags

Rare Event DetectionError-corrected DNA SequencingError-corrected RNA SequencingClonal Single-nucleotide VariantsSmall IndelsUnique Molecular IdentifiersQ5 Master MixPCRMagnetic Bead CleanupIllumina ChemistryGene Panels

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Detectie van Copy Number Wijzigingen met behulp van Single Cell Sequencing

Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen

Beoordeling van DNA besmetting in RNA Samples gebaseerd op Ribosomal DNA

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

Semi-kwantitatieve opsporing van RNA-afhankelijke RNA-polymeraseactiviteit van menselijke Telomerase Reverse-Transcriptase eiwit

Retrospectieve MicroRNA Sequencing: CDNA Bibliotheek voorbereiding Protocol met behulp van formaline-vaste paraffine-ingebedde RNA Specimens

Methodologie voor nauwkeurige detectie van mitochondriaal DNA methylatie

Het rangschikken van mRNA van geheel bloed gebruikend Nanogaatje het rangschikken

In vivo functionele studie van ziekten-geassocieerde zeldzame menselijke varianten met behulp van Drosophila

Read Article