ميكروجليا هي الخلايا المناعية الدماغ أن الدراسات الاستقصائية والرد على فسيولوجيا الدماغ غيرت من خلال تغييرات السمات التي يمكن تقييمها كمياً. هذه الخطوط العريضة للبروتوكول ImageJ على أساس تحليل بروتوكول لتمثيل مورفولوجيا microglia كبيانات مستمرة وفقا لمقاييس مثل الخلية تشعبت والتعقيد، والشكل.