Beskrevet er en metode til at kvantificere udtryk for 96 gener og 18 overflade proteiner af enkelt celler ex vivo, giver mulighed for identifikation af varierende udtrykte gener og proteiner i virus-inficerede celler i forhold til ikke-inficerede celler. Vi anvender tilgang til undersøgelse SIV-inficerede CD4+ T celler isoleret fra rhesus makakaber.