Beskrevet er en metode for å quantitate uttrykket av 96 gener 18 overflaten proteiner av enkeltceller ex vivo, tillater for identifikasjon av ulikt uttrykt gener og proteiner i virus-infiserte celler i forhold til uninfected celler. Vi bruker tilnærming til studiet SIV-infiserte CD4+ T celler isolert fra rhesus aper.