वर्णित पाइपलाइन को गीगाबाइट से बड़े इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी डेटासेट के विभाजन के लिए डिज़ाइन किया गया है, ताकि पूरे सेल मॉर्फोलॉग को निकाला जा सके। एक बार कोशिकाओं 3 डी में पुनर्निर्माण कर रहे हैं, अनुकूलित व्यक्तिगत जरूरतों के आसपास डिजाइन सॉफ्टवेयर एक गुणात्मक और मात्रात्मक विश्लेषण 3 डी में सीधे प्रदर्शन करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है, यह भी देखने occlusion पर काबू पाने के लिए आभासी वास्तविकता का उपयोग.