Her presenterer vi en protokoll for å distansere og sortere en bestemt cellepopulasjon fra Drosophila mannlige tilbehør kjertler (sekundær celler) for RNA SEKVENSERING og RT-qPCR. Celle isolasjon oppnås gjennom FACS rensing av GFP-uttrykker sekundære celler etter en flertrinns-dissosiasjon prosess som krever disseksjon, proteaser fordøyelsen og mekanisk dispersjon.