Här presenterar vi ett protokoll för att separera och sortera en specifik cellpopulation från Drosophila manliga tillbehörs körtlar (sekundära celler) för RNA-SEKVENSERING och RT-qPCR. Cell isolering åstadkoms genom FACS rening av GFP-uttrycker sekundära celler efter en multistep-dissociation process som kräver dissektion, proteaser matsmältning och mekanisk dispersion.