Journal
/
Genetics
/
الأمثل لتسلسل وتحليل العينات FFPE-RNA المتدهورة
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

الأمثل لتسلسل وتحليل العينات FFPE-RNA المتدهورة

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min

•

June 08, 2020

•

, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:21RNA Quantity and Quality Assessment
  • 02:03Sequencing
  • 04:01Data Analysis and Quality Assessment
  • 04:33Results: Representative Degraded Formalin-Fixed Paraffin Embedded (FFPE)- RNA Sample Sequencing and Analysis
  • 06:28Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

تصف هذه الطريقة الخطوات لتحسين جودة وكمية بيانات التسلسل التي يمكن الحصول عليها من عينات الحمض النووي الريبي (FFPE) المدمجة (FFPE) ذات البارافين. نحن نصف المنهجية لتقييم جودة عينات FFPE-RNA بدقة أكبر ، وإعداد مكتبات التسلسل ، وتحليل البيانات من عينات FFPE-RNA.

Tags

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

تدفق الفرز وإكسوم التسلسل من خلايا ريد-ستيرنبرغ من الليمفاوية الكلاسيكي هودجكين

الكشف عن نسخة عدد التعديلات عن طريق التسلسل خلية واحدة

الأمثل والتحليل المقارن لطرق التخصيب الحمض النووي النباتي أورغانيلار مناسبة للجيل القادم التسلسل

جيل من الكروماتين الأصلية إيمونوبريسيبيتيشن تسلسل المكتبات لتحليل كثافة نوكليوسومي

الكروماتين إيمونوبريسيبيتيشن (رقاقة) بروتوكول لعينات جنينية وفرة منخفضة

عزل الحمض النووي قوية وبناء مكتبة التسلسل الفائق للعينات دار النباتات

الكشف عن حالة نادرة باستخدام الحمض النووي لتصحيح الخطأ وتسلسل الحمض النووي الريبي

معالجات الجينوم الإدخال تسلسل إعداد مكتبة من عينة تارديجرادي واحد

التضخيم من القرب من كامل طول فيروس نقص المناعة البشرية-1 بروفيروسيس للجيل التالي التسلسل

تسلسل أشباه الموصلات للاختبار الوراثي قبل الزرع للأنوبلويدي

Read Article