Denne metode beskriver de trin til at forbedre kvaliteten og kvantiteten af sekvensdata, der kan fås fra formalin-faste paraffin-indlejrede (FFPE) RNA-prøver. Vi beskriver metoden til mere præcist at vurdere kvaliteten af FFPE-RNA-prøver, udarbejde sekventeringsbiblioteker og analysere data fra FFPE-RNA-prøver.