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分解されたFFPE-RNAサンプルのシーケンシングと分析の最適化
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Optimization for Sequencing and Analysis of Degraded FFPE-RNA Samples
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分解されたFFPE-RNAサンプルのシーケンシングと分析の最適化

DOI:
10.3791/61060-v

•

07:30 min

•

June 08, 2020

•

, , , , ,
1NCI CCR Sequencing Facility,Frederick National Laboratory for Cancer Research, 2Advanced Biomedical and Computational Sciences,Frederick National Laboratory for Cancer Research

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:21RNA Quantity and Quality Assessment
  • 02:03Sequencing
  • 04:01Data Analysis and Quality Assessment
  • 04:33Results: Representative Degraded Formalin-Fixed Paraffin Embedded (FFPE)- RNA Sample Sequencing and Analysis
  • 06:28Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

本手法はホルマリン固定パラフィン埋め込み(FFPE)RNAサンプルから得ることができる配列データの質と量を改善するステップを説明する。我々は、FFPE-RNAサンプルの品質をより正確に評価し、シーケンシングライブラリを準備し、FFPE-RNAサンプルからのデータを分析するための方法論を説明する。

Tags

FFPE-RNARNA QualityRNA DegradationSample QCLibrary PreparationSequencing ProcessRNA FragmentsSequencing ReagentsFlow CellSample LibraryPhiX Control

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