Antimikrobielle induserte endringer i Pseudomonas aeruginosa biofilmarkitektur er forskjellige mellom kliniske isolater dyrket fra pasienter med cystisk fibrose og kronisk lungeinfeksjon. Etter konfokalmikroskopi kan COMSTAT-programvare brukes til å kvantifisere variasjoner i biofilmarkitektur (f.eks. overflateareal, tykkelse, biomasse) for individuelle isolater for å vurdere effekten av anti-infeksjonsmidler.