Quantitative Analysis of Aspergillus nidulans Growth Rate using Live Microscopy and Open-Source Software

Alexandros Athanasopoulos; Ada Biratsi; Christos Gournas; Vicky Sophianopoulou

doi:10.3791/62778

Journal

/

Biology

/

ניתוח כמותי של אספרגילוס nidulans קצב הצמיחה באמצעות מיקרוסקופיה חיה ותוכנה בקוד פתוח

JoVE Journal
Biology
Author Produced

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

Quantitative Analysis of Aspergillus nidulans Growth Rate using Live Microscopy and Open-Source Software

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ניתוח כמותי של אספרגילוס nidulans קצב הצמיחה באמצעות מיקרוסקופיה חיה ותוכנה בקוד פתוח

DOI:

10.3791/62778-v

•

11:30 min

•

July 24, 2021

•

Alexandros Athanasopoulos², Ada Biratsi, Christos Gournas, Vicky Sophianopoulou

¹Microbial Molecular Genetics Laboratory, Institute of Biosciences and Applications,National Centre for Scientific Research, Demokritos (NCSRD), ²Light Microscopy Unit, Institute of Biosciences and Applications,National Centre for Scientific Research, Demokritos (NCSRD)

Chapters

00:15Introduction
01:49Inoculum Preparation
03:48Preparation of Samples for Imaging Filamentous Fungal Cells Grown on Solid Medium
05:04Preparation of Samples for Imaging Filamentous Fungal Cells Grown on Liquid Medium
05:41Live-Cell Microscopy
06:52Image Analysis
09:28Representative Results
10:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

אנו מציגים פרוטוקול הדמיה חיה ללא תוויות באמצעות טכניקות מיקרוסקופיה אור מועברות כדי ללכוד תמונות, לנתח ולכומת קינטיקה צמיחה של הפטרייה חוטית A. nidulans הן בתרבויות שקועות ומדיה מוצקה. פרוטוקול זה יכול לשמש בשילוב עם מיקרוסקופיה פלואורסצנטית.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Live-תא הדמיה וניתוח כמותי של תאים אפיתל עובריים ב Xenopus laevis</em

הדמיה ג elegans עוברים באמצעות מיקרוסקופ Epifluorescent ותוכנות קוד פתוח

כמותי תא חי פלואורסצנטי, מיקרוסקופ ניתוח של שמרים ביקוע

ניתוח כמותי של הגירה אקראית של תאים באמצעות זמן לשגות מיקרוסקופית וידאו

ניתוח כמותי של Autophagy באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי 3D מתקדם

זרימת עבודה עבור גבוהה תוכן, כימות תא יחידה של פלורסנט סמנים מUniversal מיקרוסקופים נתונים, הנתמכים על ידי תוכנות קוד פתוחות

באמצעות plusTipTracker תוכנה כדי למדוד microtubule Dynamics ב Laevis Xenopus קונוסים צמיחה

מעקב וכימות תהליכים התפתחותיים ב C. elegans שימוש בכלי קוד פתוח

ניתוח תוכן גבוה קוד פתוח ניצול מיקרוסקופי הדמית חי קרינה האוטומטית

ניתוח קוד פתוח Single-חלקיק למיקרוסקופיה סופר-רזולוציה עם VirusMapper