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Isolement et multiplexage de noyaux à faible entrée avec des anticorps à code-barres de ganglions sympathiques de souris pour le séquençage de l’ARN à noyau unique
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Low-input Nucleus Isolation and Multiplexing with Barcoded Antibodies of Mouse Sympathetic Ganglia for Single-nucleus RNA Sequencing
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Isolement et multiplexage de noyaux à faible entrée avec des anticorps à code-barres de ganglions sympathiques de souris pour le séquençage de l’ARN à noyau unique

DOI:
10.3791/63397-v

•

10:44 min

•

March 23, 2022

•

, , , , , , ,
1Department of Anatomy & Embryology,Leiden University Medical Center, 2Department of Cardiology,Leiden University Medical Center, 3Department of Medical Statistics and Bioinformatics,Leiden University Medical Center

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:59Dissection of Adult Mouse Superior Cervical Ganglia
  • 02:12Dissection of Adult Mouse Stellate Ganglia
  • 02:57Isolation and Cryopreservation of Mouse Ganglionic Cells
  • 04:56Nucleus Isolation
  • 06:50Nucleus Barcoding with Hashtag Oligos and Multiplexing
  • 08:24Results: Quality Control Analysis of Single-Nucleus cDNA Library Preparation and snRNA-Sequencing
  • 09:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Ce protocole décrit la préparation détaillée et à faible entrée de l’échantillon pour le séquençage à noyau unique, y compris la dissection des ganglions cervicaux et stellaires supérieurs de souris, la dissociation cellulaire, la cryoconservation, l’isolement du noyau et le codage à barres hashtag.

Tags

Single-nucleus RNA SequencingCardiac Sympathetic NeuronsDroplet-based SequencingHashtag OligosMultiplexingSuperior Cervical GangliaStellate GangliaTrypsin Digestion

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