Journal
/
Medicine
/
Nukleusisolasjon med lav inngang og multipleksing med strekkodede antistoffer av mus sympatisk Ganglia for single-nucleus RNA-sekvensering
JoVE Journal
Medicine
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Medicine
Low-input Nucleus Isolation and Multiplexing with Barcoded Antibodies of Mouse Sympathetic Ganglia for Single-nucleus RNA Sequencing

Nukleusisolasjon med lav inngang og multipleksing med strekkodede antistoffer av mus sympatisk Ganglia for single-nucleus RNA-sekvensering

DOI:
10.3791/63397-v

•

10:44 min

•

March 23, 2022

•

, , , , , , ,
1Department of Anatomy & Embryology,Leiden University Medical Center, 2Department of Cardiology,Leiden University Medical Center, 3Department of Medical Statistics and Bioinformatics,Leiden University Medical Center

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:59Dissection of Adult Mouse Superior Cervical Ganglia
  • 02:12Dissection of Adult Mouse Stellate Ganglia
  • 02:57Isolation and Cryopreservation of Mouse Ganglionic Cells
  • 04:56Nucleus Isolation
  • 06:50Nucleus Barcoding with Hashtag Oligos and Multiplexing
  • 08:24Results: Quality Control Analysis of Single-Nucleus cDNA Library Preparation and snRNA-Sequencing
  • 09:55Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokollen beskriver den detaljerte prøveforberedelsen med lav inngang for sekvensering av enkeltkjerner, inkludert disseksjon av musoverlegne cervical og stellate ganglia, celledissosiasjon, kryopreservering, kjerneisolasjon og hashtag-barkoding.

Tags

Single-nucleus RNA SequencingCardiac Sympathetic NeuronsDroplet-based SequencingHashtag OligosMultiplexingSuperior Cervical GangliaStellate GangliaTrypsin Digestion

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

A Model of Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis in Mouse Carotid Artery by Partial Ligation and a Simple Method of RNA Isolation from Carotid Endothelium

Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients

Innsamling og Utvinning av spytt DNA for Next Generation Sequencing

Isolasjon og forplantning av sirkulerende tumorceller fra en mus Cancer Model

Objektivt Deep Sekvensering av RNA virus fra kliniske prøver

Ny tilnærming for samtidig opptak av nyre sympatiske Nerve aktivitet og blodtrykk med intravenøs infusjon i bevisst, uhemmet mus.

Hele genomet sekvensering av Candida glabrata for gjenkjenning av markører av soppdrepende resistens

Isolering av Atrial Cardiomyocytes fra en rotte modell av Metabolsk syndrom-relaterte hjertesvikt med bevarte utstøting brøk

Isolasjon hepatocytes hovedknappen på musen for begynnende Protein syntese analyse av ikke-radioaktivt L-azidohomoalanine merking metoden

Isolering av levedyktige adipocytter og stromalvaskulær fraksjon fra humant visceralt fettvev egnet for RNA-analyse og makrofagfenotyping

Read Article