Detta protokoll erbjuder detaljerade instruktioner för att upprätta murina tunntarmsorganoider, isolera typ 1 medfödda lymfoida celler från den murina tunntarmen lamina propria och etablera 3-dimensionella (3D) samkulturer mellan båda celltyperna för att studera dubbelriktade interaktioner mellan tarmepitelceller och typ 1 medfödda lymfoida celler.