Démonstration de l’alignement des séquences pour prédire l’outil de sensibilité entre espèces pour une évaluation rapide de la conservation des protéines
00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
Ici, nous présentons un protocole pour utiliser la dernière version de l’outil SeqAPASS (Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility) de l’Environmental Protection Agency des États-Unis. Ce protocole démontre l’application de l’outil en ligne pour analyser rapidement la conservation des protéines et fournir des prédictions personnalisables et facilement interprétables de la sensibilité chimique entre les espèces.