00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
Aqui, apresentamos um protocolo para utilizar a versão mais recente da ferramenta Alinhamento de Sequência da Agência de Proteção Ambiental dos EUA para Prever a Suscetibilidade entre Espécies (SeqAPASS). Este protocolo demonstra a aplicação da ferramenta on-line para analisar rapidamente a conservação de proteínas e fornecer previsões personalizáveis e facilmente interpretáveis de suscetibilidade química entre espécies.