Summary
该协议利用琼脂糖肿胀作为一种强大且可推广的技术，用于将整体膜蛋白（IMP）掺入巨型单层脂质囊泡（GUV）中，如本文所述，用于重建人1A 5-羟色胺受体蛋白（5-HT1AR），这是药理学上重要的G蛋白偶联受体之一。
Abstract
由于质膜的复杂性以及影响活细胞中蛋白质行为的众多因素，对整体膜蛋白的结构和功能进行强有力的 体外 研究一直是一项挑战。巨型单层囊泡（GUV）是一种仿生和高度可调 的体外 模型系统，用于研究蛋白质 - 膜相互作用并以精确的刺激依赖性方式探测蛋白质行为。在该协议中，我们提出了一种廉价而有效的方法来制造GUV，其中人5-羟色胺1A受体（5-HT1AR）稳定地整合到膜中。我们使用改良的水凝胶溶胀方法制造GUV;通过将脂质膜沉积在琼脂糖和5-HT1AR的混合物上，然后对整个系统进行水润，可以将正确定向和功能性的5-HT1AR结合到膜中形成囊泡。然后，这些GUV可用于通过显微镜检查蛋白质 - 膜相互作用和定位行为。最终，该协议可以促进我们对整体膜蛋白功能的理解，提供深刻的生理洞察力。
Introduction
合成模型膜是研究生物膜基本性质和功能的强大工具。巨型单层囊泡（GUV）是研究各种质膜特性的最突出平台之一，可以设计成模仿不同的生理条件1，2，3，4，5，6，7，8。众所周知，质膜及其组织在众多细胞过程中起着关键作用，例如信号转导，粘附，内吞作用和转运9，10，11，12，13，14，15。
GUV已使用各种方法制造，包括温和的水合作用16，水凝胶溶胀17，电铸18，微流体技术19，20，21，22，喷射23和溶剂交换24，25，26。由于处理整体膜蛋白（IMP）的挑战，研究它们的 体外 平台受到限制。GUV提供了一个简化的平台，用于在模仿其原生环境的环境中研究IMP。尽管在GUV中有几种蛋白质重构的方法，但结合具有正确取向的蛋白质并保持蛋白质功能会带来挑战27。
GUV中最成功的蛋白质重构需要洗涤剂交换方法;这涉及通过洗涤剂将蛋白质从其天然环境中溶解，然后进行蛋白质纯化，然后通过各种方法用脂质代替洗涤剂分子28。虽然洗涤剂在纯化过程中用于稳定IMP的三级结构，但洗涤剂胶束对于这些蛋白质来说是一个相对不自然的环境，它们在脂质双分子层中稳定性更好，特别是对于功能研究28，29，30。此外，由于这些蛋白质的大小，细腻以及需要额外的洗涤剂交换步骤，使用传统的GUV制造技术将功能性跨膜蛋白掺入脂质双层中一直很困难27，31，32，33。使用有机溶剂去除去垢剂会导致蛋白质聚集和变性34。改进的洗涤剂介导方法一直很有希望，但是，洗涤剂去除步骤需要谨慎，并且可能需要对特定蛋白质进行优化31，35。此外，利用电铸的方法可能会限制蛋白质的选择，并且可能不适用于所有脂质组合物，特别是带电脂质31，36，37。已经使用的另一种技术是肽诱导的含有所需蛋白质的大单层囊泡（LUV）与GUV的融合，尽管它被发现是费力的，并且可能导致插入外来分子 - 梭原肽33，38，39。来自活细胞的巨型质膜囊泡（GPMV）可用于克服其中一些问题，但是它们可以对所得的脂质和蛋白质组成进行最小控制14，40，41。因此，使用我们改良的琼脂糖溶胀方法将IMPs整合到GUV的双脂层中，为在膜环境中进一步检查这些蛋白质提供了一种可靠的方法42，43，44，45。
细胞信号传导和通信涉及称为G蛋白偶联受体（GPCRs）的蛋白质家族;GPCR是最大的蛋白质家族之一，与调节情绪、食欲、血压、心血管功能、呼吸和睡眠以及许多其他生理功能有关46。在这项研究中，我们使用人类血清素1A受体（5-HT1AR），它是GPCR家族的典型成员。5-HT1AR可以在中枢神经系统（CNS）和血管中找到;它影响许多功能，如心血管，胃肠道，内分泌功能，以及参与情绪调节47。GPCR研究的一大障碍来自其复杂的两亲性结构，而GUV为研究各种感兴趣的性质提供了一个有前途的平台，包括蛋白质功能，脂质 - 蛋白质相互作用和蛋白质 - 蛋白质相互作用。已经使用各种方法来研究脂质 - 蛋白质相互作用，例如表面等离子体共振（SPR）48，49，核磁共振波谱（NMR）50，51，蛋白质脂质覆盖（PLO）测定51，52，53，54，天然质谱法55，等温滴定量热法（ITC）56，57和脂质体沉降测定法58，59。我们的实验室使用简化的GUV方法，通过包封BODIPY-GTPγS来研究脂质 - 蛋白质相互作用对蛋白质功能的影响，BODIPY-GTPγS在受体的活性状态下与Giα 亚基结合。它们的结合使荧光团解压，产生荧光信号，该荧光信号可以随着时间的推移被检测到45。此外，各种研究调查了脂质 - 蛋白质相互作用以及蛋白质在传感或稳定膜曲率中的作用60，61，利用可行的GUV方法可能是一个关键优势。
该协议展示了一种使用改性琼脂糖水凝胶系统将GPCR掺入GUV膜中的简单方法17，42。此外，基于我们之前的工作，我们的方法可能适用于可以承受短期暴露于30-40°C的IMP。 简而言之，我们铺展了一层琼脂糖薄膜与含有目标GPCR的膜片段相结合。在该层凝胶化之后，我们在琼脂糖上沉积脂质溶液，并允许溶剂蒸发。然后用水缓冲液进行系统的再水化，导致形成GUV，其中蛋白质掺入脂质双分子层。
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Protocol
1. 蛋白质标记
- 允许NHS-罗丹明，5-HT1A 膜碎片和一个7 K MWCO自旋脱盐柱在室温下平衡。
- 将1mg NHS-罗丹明溶解在100μL二甲基亚砜（DMSO）中。
- 加入5μL1M碳酸氢钠溶液，将5-HT1AR溶液的pH值提高到pH 8。
- 将3.66μLNHS-罗丹明溶液加入50μL5-HT1AR溶液中，并在微量离心管中轻轻上下移液。
注意：确保NHS-罗丹明的摩尔含量至少为10倍。 - 保持混合物避光，并在室温下放在旋转器上1小时。
- 每次洗涤用200μL1x磷酸盐缓冲盐水（1x PBS）洗涤7 k MWCO离心柱三次，每次洗涤1.5分钟。。
- 将标记的蛋白质加入一个色谱柱中，并在另一个微量离心管中平衡量。
- 在1.5 RCF下旋转标记的蛋白质一次5分钟。
- 使用纳米滴形分光光度计在280nm和554nm处获取紫外可见光度计，并按照制造商的手册计算标记效率。
- 将标记的蛋白质储存在5°C下，直到进一步使用。该溶液在贴标后约一周内稳定。
2. 采用膜 5-HT 1A 的 GUV
- 材料和试剂的制备
- 让蛋白质，脂质和BSA（牛血清白蛋白）平衡到室温。
- 在此期间，通过将盖玻片置于甲醇中并在40°C下超声处理30分钟来清洁盖玻片。 确保甲醇完全覆盖盖玻片，并且水浴中的水位高于容器中甲醇的水平。
注意：甲醇是有毒的，应在适当的化学罩中处理。 - 用柔和的气流擦干盖玻片上多余的甲醇。将盖玻片架盖在40°C的烤箱中15分钟，以确保多余的盖玻片干燥。
- 开始等离子清洗过程。首先，将盖玻片放入等离子清洗机中，并关闭进气阀以排出腔室内的所有空气。
- 一旦腔室处于真空状态，使用高RF功率设置和接近完全的真空清洁盖玻片5分钟，仅将轻微的空气吸入真空室。为确保等离子体的适当水平，请调整真空室的开口，使等离子体的最终颜色为稳定，明亮的粉红色。
注意：当使用空气时，等离子体在等离子体处理步骤期间保持明亮的粉红色至关重要，因为深紫色表示腔室中存在不适当的空气量，并将导致次优等离子体处理。 - 5分钟后，关闭射频电源并释放真空。
注：从等离子体室取出后，请确保盖玻片保持覆盖。
- 水凝胶制备
- 将 6 mg 超低温琼脂糖与 300 μL 超纯水（即 2% （w/v） 琼脂糖）混合。
注意：2%琼脂糖将用于制造无蛋白GUV。琼脂糖溶液可以在45°C下保存两天。 - 将9mg超低温琼脂糖与300μL超纯水混合，制成3 w / v%琼脂糖，如步骤3.1中制备。3%琼脂糖将用于制造蛋白质掺入的GUV。
- 在将溶液置于90°C加热块上10分钟之前，先对溶液进行短暂的涡旋。然后，在将其转移到45°C加热块之前再次涡旋管，以使其保持熔融形式，直到进一步使用。
- 将 6 mg 超低温琼脂糖与 300 μL 超纯水（即 2% （w/v） 琼脂糖）混合。
- 琼脂糖和蛋白质混合
- 将21μL3%琼脂糖与7μL5-HT1AR膜片段混合。多次缓慢地上下移液，以确保充分混合。然后，在45°C下孵育1分钟。
- 水凝胶和脂质沉积
- 对于无蛋白GUV：使用20μL2%琼脂糖在新鲜血浆清洁的盖玻片上制作薄膜。快速将另一个盖玻片滴在琼脂糖液滴的顶部，轻轻地将盖玻片分开，在两个盖玻片上形成一层薄膜。
注意：这一步很棘手，因为液滴的滑动必须发生在琼脂糖仍处于熔融形式时。 - 对于蛋白质掺入的GUV：再次上下移取蛋白质/琼脂糖混合物，然后将20μL2%琼脂糖沉积在血浆清洁的盖玻片上。按照上述滑移操作说明进行操作。
- 让琼脂糖在室温下凝胶避光30分钟。
- 将脂质滴滴沉积在琼脂糖层的顶部。在琼脂糖薄膜上使用总共10μL2mg / mL的1-棕榈酰基-2-油酰基-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）和0.4摩尔%的1，2-二棕榈酰基-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺（DPPE），标记有ATTO 488（ATTO-488-DPPE）（或感兴趣的脂质混合物）。使用气相色谱针沉积液滴，并通过温和的气流一次散布一个液滴。
注意：此步骤需要小心，以便在水凝胶顶部形成相对均匀的脂质层。此外，氯仿是有毒的，应该在适当的化学罩中处理。 - 通过将O形圈放在盖玻片的顶部，然后将腔室的顶部组件放在O形圈的顶部，来组装Sykes-Moore（S-M）腔室。使用制造商提供的钥匙，通过将腔室组件拧在一起来组装腔室，以密封腔室并防止任何泄漏。
注意：腔室的顶部应在O形圈上拧紧，但需要小心以确保盖玻片保持完好无损，因为如果O形圈不能正确放置在腔室中，盖玻片可能会破裂。此外，确保腔室密封得足够紧密，以便在添加膨胀溶液时腔室不会泄漏。如果腔室拧得不够紧，将导致泄漏和样品丢失。
- 对于无蛋白GUV：使用20μL2%琼脂糖在新鲜血浆清洁的盖玻片上制作薄膜。快速将另一个盖玻片滴在琼脂糖液滴的顶部，轻轻地将盖玻片分开，在两个盖玻片上形成一层薄膜。
- 囊泡肿胀和收获
- 通过在1x PBS中轻轻移取450μL200mM蔗糖并轻轻敲击腔室以确保水凝胶脂质层的足够缓冲液覆盖，来水合整个系统。
注意：蔗糖溶液可以用含有目标生物探针的补液缓冲液代替。 - 将腔室置于45°C，并用盖玻片覆盖腔室的顶部以防止蒸发。让样品膨胀，防止碎屑和光线照射1小时。
- 将100μL 1 mg / mL BSA在超纯水中加入到打算使用的96孔板的每个孔中。在室温下孵育1小时。
- 用超纯水洗涤三次，用200 mM蔗糖在1x PBS中洗涤一次。
- 最后，在1x PBS中加入200mM葡萄糖，直到加入GUV样品溶液。
注：BSA用于阻断GUV吸附。 - 在让水凝胶膨胀后，轻轻摇晃并敲击腔室以移开可能仍然附着在水凝胶表面的任何GUV。然后，小心地移取GUV-蔗糖溶液。
注意：作为确保所有囊泡从表面分离的可选步骤，轻轻地将一些蔗糖悬浮液移回水凝胶表面。 - 将悬浮液移动到先前制备的微量离心管中，该离心管在1x PBS中含有700μL200mM葡萄糖。
注意：密度梯度将导致囊泡沉降到离心管的底部。 - 让囊泡再沉降一小时，以确保囊泡可以沉入微量离心管的底部，从而实现最佳收集。
- 在GUV沉降在葡萄糖中后，将300μL从离心管底部（沉降的囊泡）转移到先前制备和BSA处理的96孔板中，以在共聚焦显微镜下检查囊泡。
注意：一定要避开微量离心管的最底部，以尽量减少最终样品中收集的碎屑量。
- 通过在1x PBS中轻轻移取450μL200mM蔗糖并轻轻敲击腔室以确保水凝胶脂质层的足够缓冲液覆盖，来水合整个系统。
- 在显微镜下检查样品。
- 在样品上照射488nm激光（这使我们能够可视化膜，因为双层已用ATTO-488-DPPE标记）。
- 在样品上照射561nm激光（这使我们能够可视化蛋白质，因为它已被NHS-罗丹明标记）。
注意：对样品进行成像时需要小心，因为光氧化会破坏囊泡的稳定性。在同一天观察到囊泡。
图 1：详细协议步骤的说明。创建 BioRender.com 请单击此处查看此图的放大版本。
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Representative Results
测量蛋白质的浓度，并将标记程度计算为染料与蛋白质之间的摩尔比为1：1。通过使用共聚焦显微镜检查GUV，我们能够确认囊泡的成功形成和蛋白质整合。用0.4摩尔%ATTO 488-DPPE标记脂质，并通过伯胺的罗丹明NHS酯修饰共价标记蛋白质。 图2a 和 图2b 分别显示了ATTO 488和罗丹明通道中掺入蛋白质的囊泡。所有显微照片都经过暗电流和平坦场校正。 图2c 和 图2d 显示了阴性对照GUV，没有掺入蛋白质。 图3a 和 图3b 显示了掺入GUV的蛋白质，其线强度曲线由两个通道中同一囊泡的虚线白线给出。线强度配置文件显示沿图像中白色绘制的线的像素强度的二维图。x 轴是沿线的距离，y 轴是像素强度。ImageJ软件用于绘制指示线的轮廓强度。
图2：比较蛋白质掺入的GUV和不含蛋白质的GUV（对照）的显微照片。 显微照片（a）和（b）显示蛋白质分别掺入了GUV荧光和各自的ATTO 488和罗丹明通道。显微图（c）和（d）分别显示当用ATTO 488和罗丹明通道激发时，蛋白质省略了GUV。 请点击此处查看此图的放大版本。
图3：顶行显示了ATTO 488（a）和罗丹明（b）通道中掺入的蛋白质GUV的显微照片。下面显示了指示的白色虚线的线强度分布图。使用ImageJ软件进行分析。 请点击此处查看此图的放大版本。
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Discussion
我们已经确定了对整体方案的成功至关重要的两个步骤：血浆处理和脂质沉积。盖玻片的血浆清洗对于确保琼脂糖水凝胶有足够的覆盖和粘附到玻璃盖玻片上至关重要。等离子清洗可以完成两件事：首先，它可以去除玻璃表面的有机物痕迹;其次，它激活盖玻片表面，随着玻璃表面亲水性的增加，润湿性增加62，63。等离子体清洁后触摸盖玻片表面会失活并污染超洁净表面，强烈建议不要这样做。我们的建议是在处理琼脂糖滑移铸造步骤的盖玻片时，只接触盖玻片的边缘和底面。第二个关键步骤是将脂质沉积到干燥的水凝胶表面上。该方法使用滴滴血脂沉积，这需要气相色谱（GC）针和气流一次沉积几微升脂质溶液，从而可以精确控制添加的脂质量以及脂质膜在水凝胶表面上的位置。这种方法的缺点是，如果不仔细操作，它可能导致少数几个区域具有较厚的脂质膜，从而导致GUV产量降低。因此，确保琼脂糖表面上有尽可能均匀的脂质层是至关重要的。
该协议最重要的好处之一是平台本身的灵活性; 这种方法非常适合蛋白质和脂质组成的变化，以及封装和缓冲液修饰。原则上，该协议可以包括任何跨膜蛋白，因为我们已经能够成功地掺入许多不同的跨膜蛋白，从腺苷受体（A2AR）到植物水通道蛋白，而不牺牲功能42，45，64。传统上，蛋白质在通过洗涤剂增溶或掺入蛋白脂质体或小单层囊泡后被掺入GUV中，随后可以整合到预制的GUV65中。我们改良的水凝胶溶胀方法的优点是它消除了洗涤剂或中间囊泡的依赖性，并提供中间水合支架。这样做的好处是双重的：我们可以在更生理相关的缓冲液中稳定地将功能性GPCR掺入膜中，而无需依赖洗涤剂交换方法，这些方法需要对所述洗涤剂的浓度进行更多的准备和护理，并且GUV从水凝胶表面萌芽的过程允许双层中蛋白质的正确方向66.我们已经证明，GUV萌芽过程涉及将许多较小的纳米级囊泡聚集成较大的微米级囊泡，这从一开始就鼓励正确的蛋白质取向。我们在以前的工作中已经表明了这一点。简而言之，我们共价标记靶向腺苷受体的特定胞质环的抗体，并将标记的抗体与蛋白质一起孵育，然后使用修饰的水凝胶膨胀方法将标记的蛋白质掺入脂质染料标记的GUV中。然后，我们将蛋白质掺入的囊泡暴露于带电的淬灭剂中，该淬灭剂无法穿过双层。随后，我们看到脂质染料的荧光降低了50%，但标记蛋白质的荧光仍不受淬灭剂的影响，显示出正确的取向44。
我们实验室以前的工作已经研究了脂质头基电荷，两性离子和净离子带电脂的作用，以及缓冲液和水凝胶性质，如pH，离子强度，渗透压和水凝胶浓度对GUV形成的动力学67。简而言之，脂质电荷不会在很大程度上影响GUV的形成，而缓冲液特性例如蔗糖浓度的增加（例如，185 mM离子强度PBS缓冲液中的500 mM蔗糖）会对GUV的形成产生负面影响，导致形状不规则的囊泡，很可能不容易收获。酸性溶液（pH = 3）增加形成速率，而更碱性的溶液（pH = 8）抑制GUV形成速率。GUV仍然在酸性和碱性缓冲液中形成，囊泡大小仅略有不同。低琼脂糖浓度（~0.1-1 w/v%）也会对GUV的形成产生负面影响，因为缺乏均匀的表面覆盖和水凝胶膨胀的减少，这是GUV从水凝胶表面聚结和萌芽的必要力量。因此，我们已经确定，2 w / v%的最终琼脂糖浓度与100-200 mM的蔗糖/葡萄糖溶液相结合，在pH 7.4下结合185 mM PBS的缓冲离子强度，实现了琼脂糖膨胀，GUV形成率和随后囊泡大小的良好平衡。对于含有蛋白质的囊泡，将初始琼脂糖浓度增加到3 w / v%允许在加入蛋白质溶液后最终琼脂糖浓度为2 w / v%。除了形成动力学外，蔗糖/葡萄糖缓冲液系统还有助于形成的GUV的沉降和随后的收集，以及在相差显微镜下可视化65，68。
关于该协议有一些警告点，特别是关于琼脂糖和囊泡的选择。例如，当我们使用超低熔化温度琼脂糖时，琼脂糖 - 水悬浮液需要达到至少60°C才能熔化，琼脂糖 - 蛋白质混合物在45°C下孵育。 根据我们的经验，这个温度不会消除5-HT1AR的活性，但对其他蛋白质需要谨慎。一般来说，我们使用的琼脂糖在20°C时开始凝胶化，因此溶胀反应可以在高于20°C的温度下发生，但该过程在该温度下不能起作用。还应该注意的是，温度越接近20°C，膨胀步骤的效率就越低，导致随后GUV产量下降。琼脂糖在沉降和可视化步骤中也可能出现问题，因为它可以作为碎片持续存在于沉降/收集管的底部。因此，需要谨慎使用维持熔融琼脂糖所需的温度，并确保所述温度不会使感兴趣的蛋白质变性，并吸入沉降溶液以避免任何过量的悬浮琼脂糖被包含在最终样品中。这种方法在当前状态下也导致GUV种群规模的异质性，一些囊泡显示出多层性和其他有缺陷的囊泡现象，例如囊泡内的囊泡。这是常见的GUV形成方法的典型特征，在选择囊泡进行显微镜检查和分析时需要保持警惕和谨慎。也不建议使用显示异常高水平荧光的GUV进行分析，因为琼脂糖可以在其中一些囊泡的内部找到。我们实验室未发表的工作已经能够使用使用该技术制成的囊泡进行微量移液管抽吸实验，这表明琼脂糖方法产生囊泡，而不会在腔内改变琼脂糖的力学。
撇开局限性不谈，该协议提供了一种强大而直接的方法来产生掺入的蛋白质GUV。它可以在生理相关条件下产生高产量的GUV，将正确取向的跨膜蛋白结合到双层中，而不会影响其功能。这背离了其他囊泡形成方法，这些方法涉及电流或温和的水合作用，这将显着破坏蛋白质的结构并使其无功能或需要进一步的洗涤剂增溶和去除步骤。鉴于GPCR占所有药物靶标的三分之一以上，因此人们非常有兴趣能够在高度可调性，高通量，仿生的平台上研究该系列蛋白质。更具体地说，这项工作的应用范围从蛋白质 - 脂质相互作用的研究，脂质微环境如何影响蛋白质功能和定位，以及其他可以为药物开发和发现提供信息的基本生物物理问题。这方面的一个例子可以在我们实验室内完成的工作中找到，该实验室已经能够辨别由于脂质氧化而导致的受体功能差异。
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Disclosures
作者没有利益冲突需要披露。
Acknowledgments
我们感谢Matthew Blosser的宝贵讨论和建议。这项工作得到了海军研究办公室（N00014-16-1-2382）和国家科学基金会（PHY-1915017）的支持。
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) | Avanti Polar Lipids, Alabaster, AL | 850375C-25mg | |
| TI-Eclipse inverted microscope | Nikon, Melville, NY | Eclipse Ti | |
| 1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine (DPPC) | Avanti Polar Lipids, Alabaster, AL | 850355C-25mg | |
| 13/16″ ID, 1″ OD silicon O-rings | Sterling Seal & Supply, Neptune, IN | 5-003-8770 | |
| 16-bit Cascade II 512 electron-multiplied charge coupled device camera | Photometrics, Huntington Beach, CA | Cascade II 512 | |
| 1-palmitoyl-2-oleoyl-glycero-3-phosphocholine (POPC) | Avanti Polar Lipids, Alabaster, AL | 850457C-25mg | |
| 50 mW solid-state lasers at 488 nm and emission filter centered at 525 nm, and 561 nm with emission filter centered at 595 nm | Coherent, Santa Clara, CA | 488/561-50-LS | |
| 5-HT1AR membrane fragments | Perkin Elmer, Waltham, MA | RBHS1AM400UA | |
| ATTO-488-1,2-Dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine (DPPE) | ATTO-TEC, Siegen, Germany | AD 488-155 | |
| Bench top plasma cleaner | Harrick Plasma, Ithaca, NY | PDC-32G | |
| bovine serum albumin (BSA) | Sigma Aldrich, St. Louis, MO | A9418 | |
| chloroform (CHCl3) | Millipore Sigma, Burlington, MA | CX1055 | |
| Cholesterol (Chol) | Sigma Aldrich, St. Louis, MO | C8667-5G | |
| Corning 96-well Flat Clear Bottom | Corning, Corning, NY | 3904 | |
| Elmasonic E-Series E15H Ultrasonic | Elma, Singen, Germany | [no longer sold on main website] | |
| glucose | Sigma Aldrich, St. Louis, MO | G7528 | |
| methanol (MeOH) | Millipore Sigma, Burlington, MA | MX0485 | |
| NanoDrop ND-1000 | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA | ND-1000 | |
| NHS-Rhodamine | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA | 46406 | |
| phosphate buffered saline (PBS) (10x PBS) | Corning, Corning, NY | 21-040 | |
| spinning-disc CSUX confocal head | Yokogawa,Tokyo, Japan | CSU-X1 | |
| standard 25 mm no. 1 glass coverslips | ChemGlass, Vineland, NJ | CLS-1760 | |
| sucrose | Sigma Aldrich, St. Louis, MO | S7903 | |
| Sykes-Moore chambers | Bellco, Vineland, NJ | 1943-11111 | |
| Ultra-low melting temperature agarose | Sigma Aldrich, St. Louis, MO | A5030 | |
| VWR Analog Heatblock | VWR International, Radnor, PA | [no longer sold on main website] | |
| VWR Tube Rotator | VWR International, Radnor, PA | 10136-084 | |
| Zeba Spin Desalting Columns, 7K MWCO, 0.5 mL | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA | 89882 |
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