Journal
/
Biology
/
הגנום כולו ניתוח באמצעות שבב זיהוי איזופורם ספציפי מטרות ג'ין
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

הגנום כולו ניתוח באמצעות שבב זיהוי איזופורם ספציפי מטרות ג'ין

DOI:
10.3791/2101-v

•

11:19 min

•

July 07, 2010

•

, , , , , ,
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics,University of Illinois Chicago – UIC, 2Research Unit on Biomedical Informatics,Universitat Pompeu Fabra, 3Genome Technology Core,Whitehead Institute for Biomedical Research

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:53Introduction
  • 01:33Cell Cross-linking
  • 02:39Cell Sonication
  • 04:03Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 07:06Amplification of Genomic DNA
  • 08:27Gel Purification of Amplified Products
  • 09:46Representative Results for Genome-wide Analysis Using ChIP
  • 10:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

כאן אנו מציגים immunoprecipitation הכרומטין (שבב) נוהל לניתוח הגנום כולו מיקום isoforms חלבונים שונים בתחום היסטון מחייב. אנו מיישמים אותו לניתוח שבב Seq לזהות מטרות demethylase היסטון KDM5A/JARID1A/RBP2.

Tags

Genome-wide AnalysisChIPIsoform-specific Gene TargetsTranscriptional FactorsEpigenetic FactorsProtein DomainsPlant Homeodomain (PHD)Histone ModificationsRBP2Oncogenic FusionHuman LeukemiaTrimethylated Lysine 4Histone H3 (H3K4me3)RBP2 IsoformDifferentiationU937 CellsGenomic RegionsHistone Demethylase ActivityTranscriptional Activity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Gene Expression חיידקית ניתוח שימוש microarrays

הגנום כולו ניתוח (טעינה) רמות Aminoacylation של tRNA שימוש microarrays

הגנום כולו מסך עבור מטרות מירנה שימוש יעד המשימה ספריית מזהה

כמותיים אוטומטי תפוקה גבוהה הגנום כולו RNAi המסכים ג elegans</em

הבידוד של הריבוזום פוליפפטידים המתהווה כרוכים<em> במבחנה</em> כדי לזהות אתרים השהה של תרגום לאורך ה-mRNA

אלגוריתם רומן ייס שינוי נקודות לניתוח הגנום רחב, של סוגי נתוני ChIPseq מגוונים

מחיקות Gene הגנום ב<em> סטרפטוקוקוס sanguinis</em> על ידי תפוקה הגבוהה PCR

Polysome היפוך חלוק וניתוח של יונקי Translatomes בקנה מידת הגנום

שיטת צ'יפ (DAP-שבב) מטוהרת-DNA-זיקה לקביעת מטרות גן לחיידקית שתי מערכות רגולטוריות רכיב

מיפוי הגנום של תרופות-DNA בתאי אינטראקציות עם COSMIC (Crosslinking של מולקולות קטנות לבודד הכרומטין)

Read Article