Journal
/
Biology
/
Genomvid Analys med hjälp av chip för att identifiera isoform-specifik gen mål
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Genomvid Analys med hjälp av chip för att identifiera isoform-specifik gen mål

DOI:
10.3791/2101-v

•

11:19 min

•

July 07, 2010

•

, , , , , ,
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics,University of Illinois Chicago – UIC, 2Research Unit on Biomedical Informatics,Universitat Pompeu Fabra, 3Genome Technology Core,Whitehead Institute for Biomedical Research

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:53Introduction
  • 01:33Cell Cross-linking
  • 02:39Cell Sonication
  • 04:03Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 07:06Amplification of Genomic DNA
  • 08:27Gel Purification of Amplified Products
  • 09:46Representative Results for Genome-wide Analysis Using ChIP
  • 10:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Här är vi presentera en kromatin immunoprecipitation (chip) Förfarandet för arvsmassan plats för hela analys av protein isoformer som skiljer sig en histon-bindande domän. Vi tillämpar den till chip-Seq analys för att identifiera målen för KDM5A/JARID1A/RBP2 histon demetylas.

Tags

Genome-wide AnalysisChIPIsoform-specific Gene TargetsTranscriptional FactorsEpigenetic FactorsProtein DomainsPlant Homeodomain (PHD)Histone ModificationsRBP2Oncogenic FusionHuman LeukemiaTrimethylated Lysine 4Histone H3 (H3K4me3)RBP2 IsoformDifferentiationU937 CellsGenomic RegionsHistone Demethylase ActivityTranscriptional Activity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/2101?article_type=v

Bakteriell Gene Expression Analysis Använda Microarrays
check_url/2101?article_type=v

Genomvid Analys av Aminoacylation (laddning) Nivåerna av tRNA Använda Microarrays
check_url/2101?article_type=v

Genome-wide screen för miRNA Mål Använda MISSION biblioteket Target ID
check_url/2101?article_type=v

Kvantitativa och automatisk hög genomströmning Genomvid RNAi skärmar i C. elegans</em
check_url/2101?article_type=v

Isolering av ribosom Bundna framväxande Polypeptider<em> In vitro</em> För att identifiera Translationell Paus webbplatser Längs mRNA
check_url/2101?article_type=v

A Novel Bayesian Change-punkt Algoritm för Genomvid analys av olika ChIPseq datatyper
check_url/2101?article_type=v

Genome-wide Gene Deletioner i<em> Streptococcus sanguinis</em> Av High Throughput PCR
check_url/2101?article_type=v

Polysom ​​Fraktione och analys av däggdjur Translatomes på ett Genomvid Scale
check_url/2101?article_type=v

DNA-affinitetsrenade Chip (DAP-chip) metod för att bestämma genen mål för bakteriell Två komponent regelsystem
check_url/2101?article_type=v

Genomvid Kartläggning av narkotika DNA interaktioner i celler med COSMIC (Tvärbindning av små molekyler att isolera Chromatin)

Read Article