For nylig high-throughput sekventering teknologi har i høj grad øget følsomhed af kromatin Immunpræcipitation (CHIP) eksperiment, og bedt sin ansøgning ved hjælp af oprensede celler eller dissekeret væv. Her har vi skitsere en metode til at bruge CHIP teknik med<em> Drosophila</em> Væv, som kan løse den endogene kromatin tilstand i en velkarakteriseret biologisk system.