Den compartmentalization av proteiner enten innenfor plasmamembranen eller i intracellulære steder er en regulerende mekanisme som i stor grad kan påvirke signal utfall, derfor, å forstå signaliserer det er viktig å studere den romlige og tidsmessige oppførsel av proteiner som er involvert. Vi beskriver her en TIRF mikroskopi basert system for å studere signaltransduksjon i T-celler, men er stort sett aktuelt.