Vi beskriver en levande hela djuret kvantitativ mätning för permeabilitet embryonala zebrafisk hjärnan. Tekniken analyserar förmågan att kvarhålla cerebrospinalvätska och molekyler av olika molekylvikter inom neuralrörsdefekter lumen och kvantifierar deras rörelse ut ur kamrarna. Denna metod är användbar för att bestämma skillnader i epitelial permeabilitet och mognad under utveckling och sjukdom.