Multi-modalitet billeddannelse er en værdifuld metode til at studere bakteriel kolonisering i små dyremodeller. Denne protokol skitserer infektion af mus med bioluminiscerende<em> Citrobacter rodentium</em> Og den langsgående overvågning af bakteriel kolonisering med komposit 3D diffust lys imaging tomografi med μCT billeddannelse for at skabe en 4D film på<em> C. rodentium</em> Infektion.