Mikroskala Thermophoresis (MST) kan bli mye brukt til fastsettelse av bindende affinitet uten rensing av målet protein fra cellelysater. Protokollen omfatter overekspresjon av GFP-sammensmeltet protein, cellelyse i ikke-denaturerende betingelser, og påvisning av MST-signal i nærvær av varierende konsentrasjoner av ligand.