Konfokal scanning mikroskopi används för att avbilda enskilda mitokondriella händelser i perfusion hjärta eller muskler i levande djur. Realtidsövervakning av enstaka mitokondriella processer såsom superoxidvallningar och membranpotentialen fluktuationer möjliggör utvärderingen av mitokondriell funktion i ett fysiologiskt relevant sammanhang och under patologiska störningar.