Drosophila ткани часто содержат гетерогенную смесь типов клеток. Для изучения экспрессии генов в специфические типы клеток из определенной ткани, ядра могут быть генетически помечены и затем выделяют с использованием подхода сродства основе. Изолированных ядер может быть использован для последующих приложений, таких как анализа экспрессии генов и иммунопреципитации хроматина.