ここでは、カップル2プロテオミクス技術、すなわち2次元電気泳動(2DE)および質量分析(MS)は、一次サンプルの2つ以上のグループ間で差次的に発現/翻訳後修飾タンパク質を同定するためのプロトコールを記載する。このアプローチは、一緒に機能的な実験と、予後マーカー/治療標的の同定および特徴を可能にします。