Her beskriver vi en protokoll som to par proteomic teknikker, nemlig 2-dimensjonal elektroforese (2DE) og massespektrometri (MS), for å identifisere differensielt uttrykt / post-translasjonelle modifiserte proteiner blant to eller flere grupper av foretrukne eksempler. Denne fremgangsmåten, sammen med funksjonelle forsøk tillater identifikasjon og karakterisering av prognostiske markører / terapeutiske mål.