Journal
/
Biology
/
Zuiveren van de Onzuivere: Sequencing metagenomes en Metatranscriptomes van Complex-Animal geassocieerd Samples
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Zuiveren van de Onzuivere: Sequencing metagenomes en Metatranscriptomes van Complex-Animal geassocieerd Samples

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

De cystic fibrosis luchtwegen als voorbeeld, het manuscript presenteert een uitgebreide workflow omvattende een combinatie van metagenomic en metatranscriptomic benaderingen van de microbiële en virale gemeenschappen in dieren door monsters te karakteriseren.

Tags

MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Zuiveren Plasmide DNA van bacteriële kolonies Met behulp van de Qiagen Miniprep Kit

Bruto Dissectie van de maag van de Kreeft, Homarus Americanus</em

Een Lectin HPLC-methode voor het selectief-geglycosyleerde Peptiden Enrich van complexe biologische monsters

Kwantificatie van γH2AX Foci in weefselmonsters

Chemisch-geblokkeerde Antilichaam Microarray voor multiplexverzending High-throughput Profilering van specifiek eiwit glycosylering in Complex Samples

Detectie van zogenaamde Rare Genomic Varianten uit gepoold Sequencing gebruiken SPLINTER

De MultiBac Protein Complex Production Platform in het EMBL

Gerichte RNA Sequencing Assay Gene Expression en Genomic Wijzigingen karakteriseren

Membraan Nanotubes trekken van Giant Unilamellar blaasjes

Quasi-metagenomic analyses van Salmonella uit voedsel en milieu voorbeelden

Read Article