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Optimización y Análisis Comparativo de Métodos de Enriquecimiento de ADN de Organelos Vegetales Adecuados para Secuenciación de Próxima Generación
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Optimization and Comparative Analysis of Plant Organellar DNA Enrichment Methods Suitable for Next-generation Sequencing
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Optimización y Análisis Comparativo de Métodos de Enriquecimiento de ADN de Organelos Vegetales Adecuados para Secuenciación de Próxima Generación

DOI:
10.3791/55528-v

•

12:33 min

•

July 28, 2017

•

, ,
1Cereal Disease Laboratory,United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, 2Department of Horticultural Science,University of Minnesota, 3Department of Plant Pathology,University of Minnesota

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Growing Wheat Plants
  • 01:51Organellar DNA Enrichment by Differential Centrifugation (DC)
  • 07:31Organellar DNA Enrichment by Methyl-fractionation (MF)
  • 09:44Results: Both Enrichment Methods Yield Sufficient DNA Highly Enriched for Organellar Sequences and Suitable for NGS
  • 11:33Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Se presentan la comparación y optimización de dos métodos de enriquecimiento de ADN organelar de plantas: centrifugación diferencial tradicional y fraccionamiento del gDNA total basado en el estado de metilación. Evaluamos la cantidad y calidad de ADN resultante, demostramos el rendimiento en secuenciación de próxima generación de lectura corta y discutimos el potencial de uso en la secuenciación de una molécula de larga lectura.

Tags

Plant OrganelleDNA EnrichmentNext-generation SequencingDifferential CentrifugationMeta FractionationWheat SeedlingOrganelle IsolationSTE BufferFiltration

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