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Optimierung und Vergleichsanalyse von pflanzlichen organellaren DNA-Anreicherungsmethoden Geeignet für die Sequenzierung der nächsten Generation
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Genetics
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JoVE Journal Genetics
Optimization and Comparative Analysis of Plant Organellar DNA Enrichment Methods Suitable for Next-generation Sequencing
DOI:

12:33 min

July 28, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Growing Wheat Plants
  • 01:51Organellar DNA Enrichment by Differential Centrifugation (DC)
  • 07:31Organellar DNA Enrichment by Methyl-fractionation (MF)
  • 09:44Results: Both Enrichment Methods Yield Sufficient DNA Highly Enriched for Organellar Sequences and Suitable for NGS
  • 11:33Conclusion

Summary

Automatic Translation

Der Vergleich und die Optimierung zweier pflanzenorganischer DNA-Anreicherungsmethoden werden vorgestellt: traditionelle Differentialzentrifugation und Fraktionierung der gesamten gDNA auf Basis des Methylierungsstatus. Wir beurteilen die resultierende DNA-Quantität und -Qualität, zeigen die Leistung in der Kurzzeit-Sequenzierung der nächsten Generation und diskutieren das Potenzial für den Einsatz in der Langzeit-Einzelmolekül-Sequenzierung.

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