कई जैविक प्रक्रियाओं के लिए डीएनए प्रोटीन बातचीत आवश्यक होती है। सेलुलर कार्यों के मूल्यांकन के दौरान डीएनए प्रोटीन के विश्लेषण का विश्लेषण जीन विनियमन को समझने के लिए अनिवार्य है। क्रोमेटिन इम्युनोपेरेग्रेशन (चीप) विवो में ऐसे इंटरैक्शन का विश्लेषण करने के लिए एक शक्तिशाली उपकरण है ।