Udviklingen af mikrobielle samfund afhænger af en kombination af faktorer, herunder miljøarkitektur, medlemskrænkelse, træk og interaktioner. Denne protokol beskriver et syntetisk, mikrofabrikeret miljø til samtidig tracking af tusinder af samfund indeholdt i femtoliter brønde, hvor nøglefaktorer såsom niche størrelse og indeslutning kan tilnærmes.