यह प्रोटोकॉल कार्यात्मक मिटोकोन्ड्रियल इलेक्ट्रॉन ट्रांसपोर्ट चेन कॉम्प्लेक्स (सीएक्स) चतुर्थ और अलग-अलग सुपर-कॉम्प्लेक्सेज को अलग-अलग वर्णित करता है, जो उनके विधानसभा और संरचना के बारे में जानकारी प्रकट करने के लिए देशी वैद्युतकणसंचलन का उपयोग करते हैं। मूल जेल को इम्यूनोबलॉटिंग, इन-जेल एशेज के अधीन किया जा सकता है, और अलग-अलग कॉम्प्लेक्स की विशेषता के लिए इलेक्ट्रोलाइजेशन द्वारा शुद्धिकरण किया जा सकता है।